Perencanaan RSUD Bunder Gresik difokuskan kepada penataan sirkulasi antara bangunan lama dengan bangunan baru. Penataan zonasi dan pengelompokan yang tepat serta sirkulasi yang mudah berperan untuk mendukung efektivitas dan efisiensi kegiatan yang berlangsung antar ruang di dalamnya. Bentuk massa bangunan yang kompak menjadi keuntungan untuk mengembangkan sisitem sirkulasi yang nyaman dan efisien.

Pengembangan awal dilakukan dengan melakukan optimalisasi fungsi dan lahan, serta penataan fungsi dan aktivitas yang sesuai dengan zonasinya. Salah satu aspek yang mendapat penekanan dalam proyek masterplan fisik RSUD Bunder, Gresik ini adalah penataan ruang dan jejalur sirkulasi sehingga mampu menampung kegiatan dan menunjang akses ke berbagai fungsi dan area yang saling berkait dalam keseluruhan kompleks rumah sakit.

Pengaturan massa bangunan dengan berbagai skala jumlah lantai ditujukan untuk memenuhi kebutuhan ruang yang setara dengan klasifikasi serta jangkauan layanan RSUD Bunder Gresik, mulai dari fasilitas rawat inap dalam berbagai kelas dan kapasitas tempat tidur, hingga gedung manajemen dan administrasi yang mampu melayani segenap kegiatan rumah sakit.